Re: [sbis_l] Ontologias e padrões de troca de informação em Saúde

terça-feira, 7 de dezembro de 2010
Leandra,
 
Conforme mencionado pelos colegas da lista, existem diferentes linhas de pensamento no campo das ontologias. Creio que uma boa leitura para começar a entender essas diferenças poderia ser o artigo:
 
Com relação aos padrões internacionais para Registro Eletrônico de Saúde sugiro como leitura inicial o artigo:
KALRA, Dipak. Electronic Health Record Standards. IMIA Yearbook of Medical Informatics, 2006. Disponível em http://www.schattauer.de/de/magazine/uebersicht/zeitschriften-a-z/imia-yearbook/imia-yearbook-2006/issue/special/manuscript/6382/download.html
 
Att,
 
Marcelo Rodrigues dos Santos
Ciência da Informação / UFMG
 
 
Em 7 de dezembro de 2010 19:37, Andre Andrade <andrade.andreq@gmail.com> escreveu:
Oi Leandra,

Existe, como colocado pela Luciana, muita confusão entre terminologias e ontologias em saúde, e uma ótima revisão pode ser lida em:

FREITAS, F., SCHULZ, S. e MORAES, E. Survey of current terminologies and ontologies in biology and medicine. Electronic Journal of Communication Information and Innovation in Health, v.3, n.1, p.7-18, Mar, 2009. 2009. Available at http://www.reciis.icict.fiocruz.br/index.php/reciis/article/view/239/248


Como ontologia é um termo da filosofia adotado pela computação, nem mesmo definição consensual existe. A mais repetida é a do Gruber que ontologia é "uma especialização explícita de uma conceitualização" (http://tomgruber.org/writing/ontology-definition-2007.htm) mas esse texto do Smith e Welty (http://www.cs.vassar.edu/~weltyc/papers/fois-intro.pdf) sumariza uma visão que me parece mais abrangente e robusta.


Outros sites de interesse

http://www.bioontology.org/ - página do National Center of Biomedical Ontology (NCBO)
http://ontology.buffalo.edu/ - página da SUNY Buffalo sobre ontologias, mantida pelo Prof. Barry Smith. Possui recursos sobre as abordagens filosóficas sobre a ontologia e suas aplicações recentes na computação. Bastante completo.
http://www.formalontology.org/ - página do FOIS - algumas apresentações estão disponíveis.

Sobre interoperabilidade e ontologias, uma revisão interessante está em:
NOY, N. F. Semantic integration: A survey of ontology-based approaches. Sigmod Record, v.33, n.4, p.65-70, Dec. 2004

Sobre modelos de informação como o HL7 e OpenEHR, você encontra muita informação em suas páginas principais (http://www.hl7.org/; http://www.hl7brazil.org/; www.openehr.org/). E se procurar um pouco mais consegue encontrar pessoas defendendo e atacando cada um deles de forma apaixonada, se tiver interesse.
Outro assunto que pode interessar é Web Semântica (http://semanticweb.org/wiki/Main_Page), que é uma comunidade bastante pragmática, talvez até em excesso.

O tema é bastante abrangente, veja se era isso que queria.

Abraços,
--
André Queiroz de Andrade, MD. MSc.
Health Information Technology consultant
PhD candidate - Information Science / UFMG
andrade.andreq@gmail.com
Skype: andre.queiroz.andrade



2010/12/7 Luciana Tricai Cavalini <lutricav@vm.uff.br>

Oi Leandra,

Parabéns pelo interesse no assunto mais importante (na minha opinião) em
informática em saúde.

O que você está chamando de "ontologias" são vocabulários controlados
(no caso do UMLS) e terminologias (nos outros casos).

O que você está chamando de "padrões" na verdade são especificações (HL7
e openEHR) que tiveram algumas partes transformadas em Normas ISO e/ou
CEN. "Padrão" é uma tradução da palavra em inglês "standard" que não é a
preconizada pela ABNT, que prescreve "norma". E a sigla certa do Comitê
da ISO para informática em saúde é TC215. A ABNT tem um CEE-espelho do
TC215, o CEE-78. Todos são bem-vindos a participar. E se você quer citar
"padrões" para troca de mensagens entre sistemas, não tem como não citar
a norma ISO/CEN 13606. Tem um projeto grande em 13606 na SES-MG:

http://sres.saude.mg.gov.br/

Acho que você gostaria de saber que o Instituto Nacional de Ciência e
Tecnologia - Medicina Assistida por Computação Científica (INCT-MACC)
tem um Laboratório Associado, o Multilevel Healthcare Information
Modelling (MLHIM), que por acaso eu coordeno, que tem realizado pesquisa
e desenvolvimento para superar as limitações técnicas das especificações
openEHR, mantendo a compatibilidade com sistemas desenvolvidos com base
nestas especificações. Nós estamos implementando tudo em software livre
e as especificações MLHIM são publicadas em formatos abertos. Ver mais em:

http://www.mlhim.org
https://launchpad.net/mlhim

Pesquisadores interessados, assim como estudantes de graduação e
candidatos a mestrado em doutorado em diversas áreas, são bem-vindos a
se juntar ao LA-MLHIM. Costumamos ter bolsas.

Um abraço, Luciana.



Em 07/12/2010 18:34, Leandra Carneiro escreveu:
> Amigos,
> Gostaria que vocês lessem o  post e corrigissem o que for necessário,
> já que entendem bem mais do que eu do assunto. E se possível, me
> indicassem alguma literatura onde eu pudesse entender mais sobre esse
> assunto tão interessante.
>
> Agradeço desde já,
> http://timedicina.blogspot.com/2010/12/ontologias-e-padroes-de-troca-de.html
>
> Leandra Carneiro
>

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 acredita-se estar livre de perigo.

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Postado por Nelzinho

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